세균학, 바이러스학, 면역학 연구 중심

세브란스를 설립한 에비슨의 기록에 따르면 1900년 이전부터 미생물학 관련 교과서를 편찬하였으며, 1902년부터 1907년 사이 편찬된 의학교과서들 가운데 세균학 및 현미경에 관한 교과서를 찾아볼 수 있다. 1911년부터는 본격적으로 미생물학과목(세균학)을 강의한 기록을 볼 수 있는데, 이를 통해 우리나라의 미생물학은 세브란스 의학교육과 함께 시작한 것을 알 수 있다.
연세대학교 의과대학 미생물학교실은 미생물(세균학, 바이러스학)에 대한 연구와 이들에 대한 숙주의 반응(면역학)을 꾸준히 연구하여 왔다. 우리 교실은 나병 연구 분야에서 주도적인 역할을 하여 세균학적인 연구와 더불어 우리나라에서 나병을 퇴치를 위하여 학문적으로나 사회적으로 많은 공헌을 하였다. 또한 전통적으로 항산균학(나균, 결핵균, 비결핵상산균 등)과 이에 대한 면역 반응 연구의 큰 흐름을 이어오고 있으며, 현재는 결핵균을 대상으로 연구를 진행하며 Pseudomonas aeruginosa와 Vibrio cholera 등으로 연구 영역을 넓혀 나가고 있다.